Issue

升级 PostgreSQL 9.1 的一个集群，由于该集群用到了 PostGIS，在升级 PostgreSQL 时也需要升级一下 PostGIS。PostGIS 相关软件安装好后，在 PostgreSQL 11 中创建 postgis extension 时失败，如下：

alvindb=# CREATE EXTENSION postgis;
ERROR:  could not load library "/data/pg11/lib/postgresql/postgis-x.x.so": /data/pg11/lib/postgresql/postgis-x.x.so: undefined symbol: GEOSClipByRect

Investigation

geos 是 PostGIS 的依赖包之一。通过 google 后怀疑是老版本 geos 的问题。

通过如下命令检查，确实是 geos 版本不一致。

# geos-config --version
3.x
# rpm -qa|grep geo
geos-3.y

通过定位 geos-config 绝对路径，可以确定 /usr/local/bin/geos-config 是旧版本的。

# whereis geos-config
geos-config: /usr/bin/geos-config /usr/local/bin/geos-config
# /usr/local/bin/geos-config --version
3.x
# /usr/bin/geos-config --version
3.y

通过 rpm 命令，得知旧版本 geos 并不是通过 rpm 命令安装的。

# rpm -q --whatprovides /usr/local/bin/geos-config
file /usr/local/bin/geos-config is not owned by any package
# rpm -q --whatprovides /usr/bin/geos-config
geos-3.y

将旧版本 geos rename 后，

# mv /usr/local/bin/geos-config /usr/local/bin/geos-config-x

重新进入命令行，显示正常版本

# geos-config --version
3.y

此时再创建 extension，仍然报错：

alvindb=# CREATE EXTENSION postgis;
ERROR:  could not load library "/data/pg11/lib/postgresql/postgis-x.x.so": /data/pg11/lib/postgresql/postgis-x.x.so: undefined symbol: GEOSClipByRect

Solution

经过一番周折之后，终于解决了。

在旧版本 geos 的源码目录，通过 make uninstall 卸载旧版本。

# cd geos-3.x
# make uninstall
...
 ( cd '/usr/local/include/geos/index/strtree' && rm -f AbstractNode.h AbstractSTRtree.h Boundable.h Interval.h ItemBoundable.h SIRtree.h STRtree.h )
...

查看新版本的 geos 相关文件，可知，虽然新老版本都安装在不同目录，还是会有影响的。

# rpm -ql geos-3.y|grep AbstractNode.h
/usr/include/geos/index/strtree/AbstractNode.h

此时再创建 extension，则成功了。

alvindb=# CREATE EXTENSION postgis;
CREATE EXTENSION

总结

生产环境安装软件时，也需要考虑到软件的升级与维护。源码安装会给管理软件带来一定程度的不便。

推荐进行统一配置管理(如 Ansible)，使软件的管理与配置完全自动化。